一、虫害
果实蛀虫是危害龙眼树的主要害虫之一，预防果实蛀虫主要采用的方式还是生物防治及化学防治。生物防治可以利用寄生虫，以及龙眼树的天敌来控制蛀虫的数量，化学防治则可以采用农药喷洒的方式来进行防治，但采用化学防治的同时，要注意控制用量，防止造成环境污染。
二、病害
常出现在龙眼树上的病害问题有白粉病、炭疽病及果腐病等，这几种病害问题会导致果实的品质下降，影响后期果实的产量。若出现病害问题后要及时采取合适的药剂对树体进行喷洒来进行防治。
三、叶片病害
叶片病害问题主要是有黑斑病、叶翅蚧等，这些病虫害问题会影响龙眼叶片和植株的生长。在日常种植下要及时做好防治工作，及保持果园的清洁，及时除草除虫，保持通风排水良好，这样才利于后续龙眼树的生长。
